一般禽畜糞便發酵設備采用好氧微生物有氧發酵的技術原理，使微生物利用畜禽糞便中的有機質、殘留蛋白等，在一定溫度、濕度和充足氧氣環境狀態下，快速繁殖。繁殖過程中，它們消耗糞便中的有機質、蛋白和氧氣，代謝產生氨氣、CO2和水蒸氣。同時釋放大量的熱量，使罐內溫度升高。在45℃~70℃進一步促進微生物生長代謝，同時60℃以上的溫度可殺滅糞便中的有害細菌和病原體、寄 生蟲卵等有害物質，同時平衡有益菌存活的溫度、濕度和PH值，滿足有益菌生存條件，隨著新鮮畜禽糞便不斷加入，罐內微生物循環持續繁殖，從而實現對糞便的無害化處理。處理過的熟料可以直接作為肥料使用也可以作為原料生產復合有機肥，徹底解決糞便對環境的污染問題，確保養殖行業規模化、綠色可持續發展。

畜禽糞便發酵設備技術原理一體化設備同時兼顧了好氧和厭氧兩個發酵工藝。其主要的技術原理是利用設備準確的控制發酵物料的水分（含水率）、C/N(碳氮比）、通氣狀況（含氧量）、溫度、微生物等基本的要素，利用厭氧高溫發酵到（60度）工藝快速的在20小時內殺蟲卵、然后迅速轉變為好氧低溫發酵工藝在50小時內使有機質經分解再合成，生成更復雜的特殊有機質—腐殖質，從而變廢為寶達到國家有機肥的標準。

畜禽糞便發酵設備技術原理：在畜禽糞便中添加作物秸桿或其他廢棄物，在一定水分、C/N、通風條件下，通過微生物的發酵作用將廢棄物中的有機物轉變為穩定的腐殖質，堆肥后的產品是一種良好的土壤改良劑和有機肥料，可用于有機食品或綠色食品生產，或利用部分堆肥產品進一步制成各種作物專用有機無機復混肥，用于綠色食品、無公害食品或大田生產，對減輕由于長期施用化肥造成的農村環境污染，增加土壤肥力，提高農產品品質，增加農業收入，具有良好的社會效益、經濟效益和生態效益。